Il nome Lavello, che indica la zona dove sorge l'omonimo monastero, deriva dal latino labellum: vasca per la raccolta dell'acqua.
Già in epoca romana sorgeva in questo punto un luogo fortificato, che venne trasformato in castello nel Medio Evo; la Chiesa di S.Maria del Lavello si sviluppa a partire dalla cappella del castello, sopravvissuta alla distruzione del 1373 ad opera di Bernabo' Visconti, nemico della famiglia Benaglio cui apparteneva il castello, che voleva vendicarsi dell'uccisione di un suo figlio avvenuta durante una partita di caccia nella palude nei pressi del fiume.
Il 25 Aprile 1480 un certo "Jacomino Heremitto", riparando la chiesetta diroccata esistente al Lavello, riporto' alla luce una tomba che conteneva "un corpo morto desfatto e, sotto quello li', apparse una fontana" che riempi' il sarcofago di acqua limpida e cristallina.
Il fatto fu accolto come un dono della provvidenza.
La notizia del ritrovamento si sparse velocemente nei dintorni: la gente accorse numerosa ed il giorno seguente avvenne un fatto che subito fu definito prodigioso: Martino, figlio di Antonio, abitante del monastero, all'età di otto anni, infermo e paralizzato da otto mesi "talmente che non poteva muover altro che la lingua", dopo essere stato portato alla fonte e lavato con quell'acqua, si alzo' da solo, perfettamente risanato "mediante la gratia d'Iddio e della Madonna".
Da questo momento la chiesa divento' meta incessante del pellegrinaggio e della devozione della gente.
Con il passare del tempo l'afflusso di pellegrini si moltiplicava. Si decise quindi, verso il 1486, di permettere ai frati dell'ordine dei Serviti di insediarsi, in forma non ufficiale, al Lavello per garantire una adeguata assistenza religiosa ai fedeli ed attendere alla venerata immagine della Madonna e alla fontana miracolosa.
I frati, dopo il loro insediamento ufficiale, accelerarono i lavori di restauro, o piuttosto, di ricostruzione, della chiesa che, il 19 Settembre 1490, fu consacrata da un Vescovo.
Si possono far risalire a questo periodo una parte degli affreschi che, ancora oggi, si possono ammirare all'interno della chiesa, dove lascio' la sua impronta anche il pittore Giovanni Bonzuani.
A proposito degli affreschi và detto che, allo stato attuale delle ricerche, si è persa ogni traccia dell'immagine miracolosa della Vergine. Di essa non si sa se fosse un affresco o un dipinto su tela e dove essa fosse collocata. Non è chiaro nemmeno se rappresentasse Maria Nascente, a cui la chiesa è dedicata, o semplicemente Maria Santissima o la Madonna dei Sette Dolori, tanto cara alla devozione dei Serviti.
Dopo diverse vicissitudini e contrasti col Curato di Calolzio, nel 1504 i Padri acquistarono il complesso del Lavello dalla comunità della Valle S. Martino, e cosi' poterono vivere in pace per molti anni.
Nel 1510 comincio' la costruzione del convento e nel 1582 si intrapresero i lavori per ingrandire la chiesa che terminarono nel 1585.
Nel 1630, durante l'epidemia di peste, il convento divenne lazzaretto e morirono anche tutti i monaci che vi abitavano.
Negli anni successivi continuarono i lavori di ampliamento e di miglioria del complesso.
Durante tutto il XVIII secolo i fatti salienti che riguardano il monastero si riferiscono quasi esclusivamente alle questioni sulla proprietà. La disputa intorno alla gestione dei beni del Lavello nasce in seguito alla soppressione dell'ordine del Padri Serviti, decisa dal Governo Veneto intorno al 1770. da questo momento fino alla metà del 1900 sarà un continuo rivendicare, da parte sia laica che ecclesiastica, il diritto sulle proprietà dell'ex convento, appellandosi a diverse forme giuridiche.
Prima del 1770 i beni del Lavello erano beni ecclesiastici a tutti gli effetti; tuttavia, poco dopo la soppressione, i "Vicini" della Comunità di Corte, Foppenico, Lavello e della Valle S. Martino, nel territorio di Bergamo, inoltrarono una domanda al Governo Veneto per ottenere nuovamente lo "jus patronato" del convento del Lavello, che esisteva già nella forma di consorzio laico, intorno al 1494, ma che fu sciolto con decreto del Podestà di Bergamo nel 1497.
Nel 1934 iniziarono trattative per la cessione della chiesa di S. Maria del Lavello, allora proprietà del Comune di Calolziocorte, alla chiesa parrocchiale di S. Martino Vescovo. Venne poi deciso, il 1° Dicembre 1935, di cedere la suddetta chiesa, tutta l'ala sinistra dell'ex convento e parte dell'ala destra fino alla scala, in cambio di uno stabile esistente nella frazione di Foppenico, che avrebbe dovuto trasformarsi in ospizio.
Durante l'ultima guerra l'edificio, a seguito del bombardamento del vicino ponte ferroviario, subi' il danneggiamento del tetto, ricostruito poi grazie ad una colletta popolare.

Sembra certo che il nome Lavello derivi dal latino "Labellum" vasca o pila per la raccolta dell'acqua. S.ta Maria del Lavello sorge proprio in questo punto così da diventare la protettrice della chiesa.
Nell'alto medioevo diventa una vera e propria "Curtis". Questa trasformazione si spiega con l'organizzazione dei territori e la gestione amministrativa che facilitava lo svilupparsi della attività diverse. La tranquilla e produttiva curtis si trasformò in un "Castrum", controllato dai nuovi proprietari terrieri e di nuovo organizzata in modo difensivo.
La chiesa di Milano rivendicò la proprietà del Lavello con una postilla del sacerdote della stessa frazione, ma nel 1014, l'imperatore Enrico II° sottrasse con un diploma: "possesium Curtis de Lemine cun eius adiacentis", alle: "Faucibus inimicorum" e il Lavello viene riconosciuto come Castellum.
A questo punto la località non è più un luogo indefinito ,ma un complesso edificativo vero e proprio.
Nel 1373 la strage bellica della valle S. Martino ebbe le maggiori perdite tra cui il castello fortificato appartenente alla famiglia Benaglio.
Alla fine del 1400 si comincia ad associare il Lavello una funzione religiosa ben precisa, che richiede da una parte l'amministrazione dei beni immobili mentre dall'altra la gestione del culto e il rispetto per la sua osservanza. La decisione di affidare la chiesa di S.ta Maria del Lavello comportò un iniziale insoddisfazione per gli abitanti della Valle San Martino, che intrapresero una risvolta sia dal punto di visat politico, sia dal punto di vista religioso.
Gli abitanti riunitisi il 2 luglio del 1489 nella casa di Bartolomeo Rota, decisero, con il consenso Don Pasino Mazzoleni, di affidare la chiesa del lavello a una congregazione di osservanti regolari che avrebbero avuto il compito di custodire la chiesa, di spendere le offerte e l'elemosina a beneficio della medesima e di edificare un monastero.
Nel 1719 si aggiungono oltre al monastero si aggiungono " tutte le case, ara horto e pratto in faccia del lavello" .
Prima del 1770 i beni della Lavello erano beni ecclesiatici a tutti gli effetti; tuttavia poco dopo la soppressione, i "Vicini" della comunità di Corte, Foppenico ,Lavello e della Valle San Martino, nel territorio di Bergamo, inoltrarono una domanda al Governo: "Jus patronato" del convento del Lavello, che esisteva già nella forma del consorzio laico, intorno al 1494, fu sciolto con decreto del Podestà di Bergamo nel 1497.
Il 10 marzo del 1774, con atto pubblico venne restituita dalla repubblica veneta.
Negli ultimi ottant'anni del Lavello furono all'insegna di patti e cambi di proprietà tra il comune di Corte e la chiesa di Calolzio.
Queste dispute impedirono una gestione organizzata.
Una certa attenzione da parte di Corete per i diritti spettanti al Lavello comincia a prospettarsi nel 1903.
Questa tendenza fu confermata coi patti L'alternarsi nel 1929.
Nel 1934 la chiesa di S.ta Maria del Lavello fu divenuta proprietà della chiesa di S. Martino.
Ci furono diverse dispute per il possesso dei due terreni e alla fine venne divisa in due: Calolziocorte e la valle S.Martino nell'anno 1965 del 25 ottobre.
In seguito alla seconda guerra mondiale il monastero è in ristrutturazione.